心中十分高兴，经过请示，他批准朱载堉进入太学参与研究，朱载堉成为大明宗室中第一位以藩王身份进入太学的宗室。
嘉靖二十年四月二十四，太上皇朱厚照感到身体不豫，召朱载坖、赵贞吉、高拱、海瑞及张居正等人前往大明宫。
四月二十六日，朱厚照驾崩于大明宫长寿殿内，享年七十三岁。
对于朱厚照的驾崩，民间百姓大多惋惜，而许多权贵则是弹冠相庆。
经过五十四日的停灵，朱厚照下葬天寿山康陵。
朱厚照死后，庙堂开始针对朱厚照的功绩来评定庙号和谥号。
张居正、高拱认为应该上武宗，而徐阶等人认为应该上德宗。
经过朱载坖思虑，最终还是为朱厚照上庙号为武宗，谥号为“承天达道英肃睿明昭德显功武毅孝纯皇帝。
此事裁定，朱载坖也终于在即位二十年后彻底掌握了大权。
彼时的他四十三岁，而朱厚照留给他的文臣武将可谓豪华。
文臣有赵贞吉、高拱、胡宗宪、张居正、谭纶、徐阶、严世蕃、海瑞、李化龙
武将有戚继光、戚继美、俞大猷、李成梁、李如松、戚金、陈磷等等
这群人从三十岁到七十岁不等，足够好好辅佐朱载坖。
或许就连朱载坖都这么认为，所以在他彻底掌握权力后的第二年，他便下令废除昆仑洲流配官员的罪籍，祝续因此得到释放。
此外，朱载坖改十日一次的常朝为一月一次，并将部分权力下放给了六部和殿阁。
在他的宽仁下，大明朝进入了一种诡异的平和时期。
嘉靖二十四年，朱载堉提出光子假设、成功解释了光电效应，因此获得了朱载坖的赏赐。
次年，朱载堉创立狭义相对论，并于三年后创立广义相对论。
在长时间的交流中，太子朱翊釴与朱载堉相谈甚欢，二人除了在理论上研究出了交流电，还于嘉靖二十六年发明了交流电的发电机，以及发明钨丝电灯。
嘉靖二十八年，二人观测天文时发现了大明朝的气温增长速度变缓，甚至有降温的可能。
二人上奏朱载坖，但却没有什么能处理的好办法。
嘉靖三十年，气温增长果然到了极限，世界气温开始进入平稳期。
嘉靖三十四年，太学发明了尿素、钾肥和抗生素，这使得粮食产量得到提高，许多疾病也得到治愈