却给了朝堂一个错误的信号。大臣们以为皇帝驳斥倪元璐只是给金天启面子，实际上还是开始平反东林党人了。于是，风向开始偏了。更多的大臣，特别是那些新上来的大臣，开始为平反东林党人呼告。
最后，崇祯皇帝顶不住压力，下旨赠恤杨涟太子太保、兵部尚书；左光斗右都御史；赠恤魏大中、周顺昌为太常卿。也不追究倪元璐出言不逊。一场新的清算运动就又开始了。御史罗元宾跳出来攻击内阁首辅施凤来和张图瑞，两人坐不住了，提出辞职，崇祯皇帝就准了。
这头一开，其他处于灰色地带的一大批官员也而被清算了。连和魏忠贤不对付的是魏忠贤同乡的李国(普)也坚持辞职，要知道他在朱由校复活后，还是力挺朱由检的。于是，来宗道成为了内阁首辅，东林人韩爌和孙承宗被召回。..ćőm
这个倪元璐斗争上瘾了，他开始拿三朝要典开刀了。三朝要典里面有大量贬低东林人和歌颂魏忠贤的文字，这就是关键点。首先出来反对的是翰林院侍读孙之獬和兵部尚书霍维华。孙之獬甚至当众大哭，哭完要求辞职。而霍维华经过灵露饮事件后，如获新生，虽然现在是崇祯朝了，他决定死心塌地跟着金天启走，所以有人要出来针对天启皇帝首肯的三朝要典，他当然要反对，只是没有孙之獬那么激烈。而内阁里作为当年副总编有来宗道和杨景辰，但圆滑的来宗道没表示反对，只是要求礼部史馆详议。崇祯皇帝表示这事要去问询一下金天启的意见后，由他独断专行。
金天启在获悉朝堂上的这场政治运动后，表了个态。他先收回为三朝要典作的序言，然后建议朱由检去掉里面歌颂魏忠贤和贬低东林党人的部分后，把主要内容写进正要修订的熹宗实录。当然，改过的三朝要典也可以更名为朱由校的一生的话本。(具体内容可以去看外传，从033开始。)
倪元璐胜利了，东林人胜利了。其实，倪元璐也有赌的心思，毕竟金天启还在，只要他老人家生气了，倪元璐必定死无葬身之地。然而，他就一个小小的编修，不赌哪来前程。他就是新势力推出来的一个刺客。
崇祯皇帝下旨：天启圣人收回三朝要典序言，三朝要典不再作为官方文件。三朝要典所载三朝诸事，皆收入熹宗实录。
自今以后，官方不以此事定臧否，人才不以此书定进退，惟是三朝无遗议，绍明前烈，注意编摩。诸臣各宜捐去成心，勿滋异论，务衷清平之治。
此圣旨一出，崇祯皇帝觉得既保全了老哥的面子，又安抚了旧